本发明公开了一种用于深水浅覆盖层河床的钻孔平台及其施工方法，涉及钻孔平台技术领域，所述钻孔平台包括：多个桩基和连接梁，多个桩基与浅覆盖层河床固定连接，每个所述桩基均包括钢管桩和混凝土锚桩，每个所述桩基的钢管桩插设在浅覆盖层河床上，每个所述桩基的钢管桩的内部灌注混凝土形成对应的混凝土锚桩，所述连接梁固定设在多个所述钢管桩顶端，所述连接梁上用于设置顶面板。本发明的每个桩基的钢管桩插设在浅覆盖层河床上，一方面，钢管桩可以为对应的混凝土锚桩施工进行导向；另一方面，钢管桩可以作为支撑用于钻孔平台上部的连接梁的施工，且桩基施工和连接梁施工互不干扰，可提高施工效率，节省施工工期。