本发明涉及故障预测技术领域，具体为一种基于组件调用分析的计算系统故障预测方法和系统，包括：获取待预测组件的关联组件集合，采集其中每个组件的监测数据，进行处理，形成加权时序数据矩阵；根据关联组件集合，获取调用关系序列数据向量；获取采集监测数据的时刻开始预设时间间隔内的故障状态数据；根据加权时序数据矩阵、调用关系序列数据向量和故障状态数据，获取输入输出数据组；提取加权时序数据矩阵和调用关系序列数据向量的特征，进行融合，建立与实时故障状态数据的对应关系，形成分类预测模型；对分类预测模型进行训练优化，输出满足预设预测精度的分类预测模型。本方案能融合组件动态调用关系，以提高故障预测精度。