本发明公开了一种配电智能终端的加密认证方法、系统及存储介质，包括包括以下步骤：在云端认证服务器添加待认证的配电智能终端的网络标识；通过已认证的配电智能终端扫描处于同一无线局域网内的其他配电智能终端的网络标识；将扫描到的配电智能终端的网络标识与云端认证服务器已存储的网络标识进行匹配，若匹配，则云端认证服务器对配电智能终端的身份进行加密认证处理，若加密认证成功，则云端认证服务器为配电智能终端分配一个登录令牌，用于允许配电智能终端登陆；实现了对配电智能终端进行在线身份加密认证，安全可靠，且认证过程快速。