本发明涉及一种基于芬顿原理的重金属废水处理系统及装置，系统包括：第一处理单元和第二处理单元。阳极废水流送入第一处理单元中的第一物化沉淀池中，蚀刻褪镀废水流送入第二处理单元的芬顿反应单元进行处理，和在第二物化沉淀池中进行物化沉淀；芬顿反应单元被配置为：在酸性条件下通过二价铁离子和过氧化氢的混合产生羟基自由基并以链式反应实现对有机物的降解。其中，芬顿反应单元包括反应部、中和池、脱气池、混凝反应池和终沉池。本发明将电子工业重金属废水分别送入第一处理和第二处理中，通过减量化和脱盐处理将产生的产水流回用，产生的浓水流蒸发结晶，从而充分利用包括阳极废水流和蚀刻褪镀废水流等，以达到高回用、高利用的目的。