本发明涉及一种多通道的太赫兹扫描系统，包括相互连接的太赫兹探头和光谱仪主机，系统还包括横向移动组件、纵向移动组件、扫描屏和支撑整个系统的外壳体，纵向移动组件固定在横向移动组件的移动端，太赫兹探头的数量不少于四个，各个太赫兹探头均并排固定在纵向移动组件的移动端，并朝向扫描屏。与现有技术相比，本发明实现太赫兹探头的横向移动和纵向移动，能在扫描屏上实现地毯式扫描，设置至少四个太赫兹探头，能同时进行扫描处理，使得各个太赫兹探头均在对应的工作区域内同时工作，大幅提高了太赫兹扫描效率。