本发明公开一种跨安全区闭环控制系统和方法，包括部署于电力信息内网的SCADA系统、指令接收子系统和中间数据库，部署于互联网大区的指令转发子系统，以及多个客户侧用能控制系统CPS；指令转发子系统通过网络隔离装置访问中间数据库，通过防火墙与各CPS通信连接；指令接收子系统接收SCADA系统下发的CPS控制指令数据，处理后写入中间数据库，指令转发子系统从中间数据库读取处理后的控制指令数据，访问对应的CPS设备控制接口发送设备控制请求，并接收CPS响应数据，处理后写入中间数据库，指令接收子系统从中间数据库读取处理后的CPS响应数据，转发至SCADA系统。本发明能够在满足安全防护要求的前提下，实现部署于电力信息内网的SCADA系统对互联网环境中用能设备的闭环控制。