本发明涉及表格数字化技术领域，公开了表格拓扑结构的矩阵表示方法及系统，该矩阵表示方法，基于格子各边的状态构建状态编码表，再根据状态编码表判定所获取的待表示表格中各格子的编码，从而得到表格拓扑结构的矩阵表示；其中，格子各边的状态指格子各边是实线还是虚线；若所获取的表格为规范表格，则直接判定所获取的待表示表格中各格子的编码；若所获取的表格为非规范表格，则先将表格转化为规范表格，再判定所获取的待表示表格中各格子的编码。本发明解决了现有技术表示表格拓扑结构存在较大冗余、不便于比较表格拓扑结构的相似性等问题。