本发明涉及一种考虑碳排放配额影响与区域污染物浓度约束的环境经济调度方法，采用A值法计算区域大气环境容量系数，确定各区域环境污染物浓度阈值；基于传统基准值法、考虑污染物浓度阈值确定各区域碳排放初始配额，从而建立碳交易成本模型；采用多源高斯烟羽扩散模型从时间、空间、浓度三个维度，建立燃煤机组污染物浓度分布模型；考虑污染物浓度约束与碳交易成本建立环境经济调度优化模型。与现有技术相比，本发明考虑区域环境差异性进行初始碳排放配额的分配，从控制碳排放量和限制污染物浓度时空分布出发建立优化模型，合理调整机组出力，缓减污染物浓度阈值较低区域的环境压力。