本发明公开了一种串口的加密通信方法，客户端与服务器使用私有协议数据封装格式的报文和ukey进行双向身份认证；根据实际业务需求，客户端与服务器在数据传输时，使用私有协议数据封装格式的报文进行明文数据传输，或者使用私有协议数据封装格式的报文和ukey进行密文数据传输。当客户端与服务器之间停止数据传输，客户端使用私有协议数据封装格式的报文进行通信链路的验证。本发明提供的一种串口的加密通信方法，增加了信息篡改成本，能够实时准确确认操作者身份，禁止非指定客户端连接，可以对数据准确分割，用来传输加密数据。