本申请涉及细胞分装技术领域，提供一种细胞分装制冷系统及细胞分装方法。细胞分装制冷系统，包括控制模块、制冷面板、压缩机、温度检测模块、液体输入模块和液体输出模块，制冷面板用于安装液袋，压缩机与控制模块连接，压缩机用于向制冷面板输送制冷液，温度检测模块安装在制冷面板上，温度检测模块与控制模块连接，温度检测模块用于检测液袋的温度，使得控制模块适于根据液袋的温度对压缩机的功率进行调节，液体输入模块与液袋连通，液体输出模块与液袋连通。根据本申请实施例的细胞分装制冷系统，实现了对细胞液体的自动化降温及分装，提高了系统的自动化程度，实现了对压缩机功率的自动化调整，降低了系统的功耗。