本发明提供了智慧环保平台水环境管理系统的污染分析管理模块及方法。该方法包括：获取水环境基础数据，水环境基础数据包括监测断面基本信息、主要流域水文基本信息和废水污染源排放基本信息；根据水体流向确定各监测断面的上下游关系，确定水系干流与各主要支流的汇入、流出关系，获取各废水污染源的废水排放去向和排口位置；将各水系干流以监测断面为界限划分为若干个控制单元，每个控制单元的上下游边界是两个相邻的监测断面，基于控制单元构建溯源关系模型；获取每个监测断面的水质数据，当水质数据超标时，根据溯源关系模型获取污染来源。本发明能够有效提升制订污染防治决策的效率和效果。