本发明涉及智能控制技术领域，具体涉及一种压载水紫外线反应器的智能控制方法，该方法包括：获取目标船舶的当前压载水流速和历史压载水流速集合；根据当前压载水流速、历史压载水流速集合和流速预测网络，预测目标时刻下的目标预测流速；确定目标时刻下的目标流速；确定目标时刻下灭活压载水中微生物所需要的紫外线灯管功率；控制紫外线反应器，使紫外线反应器内的紫外线灯管的功率在目标时刻下调节至目标功率。本发明利用当前压载水流速和历史压载水流速集合，能够实现对压载水紫外线反应器进行控制，解决了对紫外线反应器控制的精确度低下的技术问题，提高了对紫外线反应器控制的精确度，主要应用于对紫外线反应器进行控制。