本发明提供了无地面观测条件下湖泊水域多源降水融合方法及系统，涉及电数字数据处理领域。融合方法包括：采集湖泊水域三套相互独立的降水估测数据，构造降水估测数据三重组合；基于三重组合的分类型和定量型精度评估单元，计算各套降水估测数据的综合分类精度、均方根误差和相关系数；基于精度评价结果，输出有雨无雨状态融合权重与降水量融合权重；分别开展降水状态融合与降水量融合计算，并将二者输出的时间序列对应相乘，输出湖泊水域多源融合降水估测数据集。本发明方法解决了湖泊水域因无地面观测数据引起的栅格降水估测数据精度评价与误差订正的难题，并可通过多源降水融合实现栅格降水估测数据分类和定量误差双重订正。