本发明公开了一种快速固化双组份聚氨酯遇水膨胀密封胶及其制备方法，制备方法包括以下步骤：将第一聚醚多元醇、扩链剂和催化剂混合，在搅拌条件下，于100～120℃、真空度0.05～0.10Mpa的条件下脱水1～2小时，直至水分含量位于0.05wt％以下，得到固化剂组份，将增塑剂、填料、触变剂、高吸水性树脂和第一环氧树脂于100～120℃干燥3～5h，降温至30～50℃，加入固化剂组份，搅拌均匀，在氮气保护下加入除水剂和增粘剂，于25～45℃下继续混合搅拌1～1.5h，得到A组份，将B组份与A组份混合，得到快速固化双组份聚氨酯遇水膨胀密封胶，本发明快速固化双组份聚氨酯遇水膨胀密封胶其主链含有亲水基团，遇水膨胀后性能稳定，析出物少，膨胀倍率高且可调，抗水压能力好。