本发明涉及无人机测绘技术领域，具体公开了基于无人机的地貌测量方法及系统，其中系统包括区域规划模块、航线规划模块、图像分析模块、数据处理模块以及若干无人机；区域规划模块用于将地貌测量作业区均匀划分为若干网格；航线规划模块用于根据网格的数量确定无人机的数量，根据无人机的数量规划测量航线；无人机用于按照规划的测量航线飞行，拍摄作业区的航拍影像；图像分析模块还用于从通信模块获取航拍影像，进行初步筛查，判断成像质量是否满足需求，若不满足，标记对应的网格；数据处理模块用于从通信模块获取POS数据，根据航拍影像、POS数据和像控点的坐标进行空中三角形计算，生成数字正射影像图。采用本发明的技术方案能够提高测量效率。