一种含还原铁粉的湛水直播水稻种衣剂、其包衣方法及应用，所述种衣剂包括还原铁粉∶复合粘合剂＝10∶1.0‑5.5，重量比；其中，所述还原铁粉中铁≥98.5％、碳≤0.02％、磷≤0.02％、硫≤0.02％、硅≤0.20％、锰≤0.4％、氢损≤0.2％，粒径大于400目的铁粉占还原铁粉总量的70％以上；所述复合粘合剂是由硫酸钙与过氧化钙或水产饲料粘合剂复合而成。本发明在包衣时，在增加种子密度的同时，大大减少了铁粉的使用量，直播后稻种落土较深，防止种子漂浮，保护种子不被鸟类啄食，发芽率比未包衣稻种提高9.0％‑16.7％，增加发芽势、出苗率、齐苗率、秧苗素质和抗低温能力，预防苗期病害和控制苗期杂草，节约水肥，提高资源利用效率和减少环境污染。