本发明公开了一种连续合成生物质衍生呋喃化合物的方法及装置，该方法为：向填充有酸性催化剂颗粒的封闭容器中加入质量浓度为0.1％～50％的化合物水溶液和有机溶剂，在50～200℃、0～3MPa条件下，反应10s‑30min后，得到生物质呋喃衍生物。该装置为包括原料罐、溶液罐、原料泵和溶液泵、微填充床反应器、背压阀；所述原料罐和所述溶液罐的出液口分别通过管路与所述微填充床反应器的两个进液口相连，所述原料罐与所述微填充床反应器的连接管路上设有所述原料泵，所述溶液罐与所述微填充床反应器的连接管路上设有所述溶液泵，所述微填充床反应器的出口管路上设有所述背压阀。本发明装置和方法实现合成糠醛或5‑羟甲基糠醛的连续生产。