本发明提供一种基于误差控制的水质监测系统及方法。所述系统包括：主控单元和与所述主控单元相连的传感器模块、CCD模块和通信模块；传感器模块用于实时采集检测箱内水质参数数据，CCD模块用于拍摄检测箱内水面的视频图像，主控单元主要用于基于所述视频图像计算水色度，并基于水色度与水质参数的关系实时估算当前时刻水质参数的测量误差，如果所述误差超过设定阈值，丢弃水质参数当前时刻的测量值，通信模块用于向监测中心的上位机实时上传水质监测数据。本发明通过测量水色度，基于水色度与水质参数的关系估算水质参数的测量误差，并丢弃测量误差超过设定阈值的测量值，提高了水质参数监测的精度。