本发明提供了一种异形板切割路径优化方法及系统，包括以下步骤：S1、生成初始的多个零件领导小组；S2、通过贪心策略筛选出部分空刀距离总和较短的领导小组存储到待搜索领导小组集合中；S3、对多个零件领导小组进行寻优；S4、将一个组中与左右零件连线较长的零件迁移到其他组和将其他组中合适的零件插入到本组中零件间连线较长的两个零件中间的后处理方式不断迭代优化较长的空刀线，以获得整个切割路径距离的最短距离；S5、将所得到的切割路径与全局最优路径进行比较和选优；S6、遍历完所有待搜索领导小组之后，返回全局最优的完整版面切割路径。本发明的切割路径优化好，且计算时间快，空切行程路径较短，切割效率高。