本申请提出基于全物理过程的风电场实时功率估算方法及系统，所述方法包括：确定风电场中的第一类风电机组和第二类风电机组，并获取风电场中各风电机组的最大输出功率、入流风速和机械转动惯量；确定第二类风电机组中各风电机组的实时输出功率估计值；根据各风电机组的入流风速和机械转动惯量对第二类风电机组中的各风电机组的实时输出功率估计值进行修正；确定各风电机组修正后的实时输出功率估计值和第一类风电机组中各风电机组实时输出功率之和，并作为风电场的实时功率估计值。本申请提出的技术方案，基于能够获取输出功率信息风机估算出未知风机的实时输出功率，从而对于风电场站整体的输出功率进行整体估算，估算结果的准确性有了较大提升。