本发明公开了一种穿层钻孔封孔装置及其使用方法，包括外表面开设有安装孔的定位座，所述安装孔的一侧螺纹连接有可密封的安装座，所述安装座外表面的一侧固定安装有可驱动的电机，所述电机的输出端通过键连接有可转动的连接轴，所述连接轴的一侧卡接有可驱动的传动杆，所述传动杆的外表面套接有可刮平的定位轮。该穿层钻孔封孔装置及其使用方法，通过定位轮和钻头的配合设置，可以在打孔的过程中，也能够对孔的周围进行打磨，从而更方便后期进行注浆操作，从而提升整体的密封性，通过定位管的设置，可以将钻孔的周围进行阻挡和密封性，并且在注浆完成后，能够最大限度的进行密封，从而减少泄露。