本发明涉及一种考虑出入口密度测量的井口节流压力精细调控方法及系统，其包括：据井底目标压力和井底压力初值，获取井口回压初值；根据井口回压初值及作业井出入口的钻井液密度差，对井口节流压力进行精细循环调控，将井口回压调整至目标值，获取井筒内钻井液密度分布；根据井筒内钻井液密度分布精确计算得到井底压力，根据井底压力与井底目标压力，更新井口回压值，调整井口回压至目标值，循环更新井筒内密度分布、井底压力及井口回压值，直到钻井结束。本发明能实现井筒压力精准调控的目的，避免钻完井井涌、漏失等复杂事故的发生；可以在油气开发钻完井工程领域应用。