一种时钟异常跳变监控系统，包括：系统时钟模块，用于提供目标系统时间；时钟异常跳变监控模块，耦接于系统时钟模块，用于对系统时间异常跳变进行监控；报警处理模块，耦接于时钟异常跳变监控模块，用于当系统时钟发生异常跳变时输出报警信息；变量存储模块，耦接于时钟异常跳变监控模块，用于当系统时钟发生异常跳变时锁存异常跳变值和异常跳变时间；人机接口模块，耦接于报警处理模块和变量存储模块，用于显示报警相关信息以及复位报警处理模块。本公开能够实时监控目标系统时钟，当发生系统时钟异常跳变时发出报警，定位系统时间异常跳变的时间和跳变值，方便人员进一步检查和处理，防止时钟异常跳变引起的不确定性后果进一步扩大。