本发明提供了一种变电二次设备的安全运维管理方法及系统，涉及数据处理技术领域，通过构建并基于变电二次设备运行监测数据库对变电二次设备进行运行数据风险性评估获得各变电二次设备风险等级并筛选确定安全运维设备信息；根据安全运维设备信息、变电二次设备的风险等级确定设备加密列表；根据设备加密列表，生成安全运维管理信息进行运行数据加密传输，基于电网调度准则判断传输的运行数据是否存在异常，从而针对性进行异常消除。解决现有技术中对于变电二次设备异常状况发觉和处理的即时性不足且运维管理对于人工经验依赖度较高的技术问题。达到了基于数据智能分析处理及时发觉并运维变电二次设备异常，提高变电站运行安全度的技术效果。