本发明提供了一种基于虚拟振荡器控制器的微电网运行模式平滑切换方法。该方法包括：基于全逆变器微电网的稳态指标确定逆变器的关键控制参数；逆变器并网启动后，将逆变器的出口电流与参考电流之间的差值输入至虚拟振荡控制器；逆变器进行预同步操作时，基于预同步时间要求确定逆变器的预同步参数，同时改变控制器的输入为逆变器出口电压与电网电压的差值；当逆变器的出口电压与网侧电压之间的相位差小于某一阈值ε后，并网开关切换，逆变器切换至并网运行模式，虚拟振荡控制器输入重新变为逆变器的出口电流。本发明考虑电网稳态电压频率指标与预同步时间要求，实现微电网运行模式的平滑切换，保障电网内重要负荷的不间断供电。