本发明提供一种航天器供配电分系统在轨飞行仿真测试方法，包括：获取航天器供配电分系统在轨飞行的实际数据；基于实际数据，构建航天器数字模型和航天器供配电分系统仿真任务模型，并配置仿真任务模型参数；基于航天器数字模型和航天器供配电分系统仿真任务模型，利用仿真软件仿真航天器供配电分系统在轨飞行，获得仿真结果；根据仿真结果，利用太阳能电池阵列模拟器和半物理仿真系统测试评估航天器供配电分系统的安全裕度。本发明通过建立航天器数字模型和仿真任务场景，获得航天器供配电分系统在轨飞行的仿真数据，为航天器供配电分系统的安全裕度评估提供了可靠的数据支持，可提高安全裕度评估的准确性。