本发明提供了一种变电站碳排放监测方法及系统，该方法包括：确定发电连接关系和变电站支路连接关系；获取电力系统的实时潮流功率；计算实际发电量和变电站实际潮流功率；确定电力系统的线路碳源节点并确定与线路碳源节点相连的变电站组；构建分布式碳排放解耦计算模型；将实际发电量和变电站实际潮流功率作为分布式碳排放解耦计算模型的输入，计算变电站组的碳排放数据组；根据变电站碳排放数据组获取待监测的变电站碳排放数据，完成对变电站的碳排放监测。本方法将实时潮流功率和分布式计算结合，实现对电力系统的变电站的碳排放数据计算，大大降低了计算复杂度，满足对变电站碳排放的高效、实时监测，提高监测的可靠性。