本发明公开了一种基于智能励磁电流法的同步发电机转子匝间短路诊断方法及系统，方法包括：收集有功功率、无功功率、定子电压、定子电流和励磁电流的样本值；以有功功率、无功功率、定子电压、定子电流作为输入量，以励磁电流的样本值作为输出量，提交机器学习模型训练，获得训练好的模型；获取有功功率、无功功率、定子电压、定子电流和励磁电流的实时值；将有功功率、无功功率、定子电压和定子电流的实时值作为输入量，输入训练好的模型，预测获得励磁电流拟合值；计算励磁电流实时值与拟合值之间的偏差值，根据偏差值判定转子是否发生了匝间短路，并标示匝间短路严重程度。本发明部署实施难度低，诊断结果准确可靠。