本发明公开了一种可灵活定义的继电保护系统及方法，包括采集执行单元，通过监测传感器获取监测信息；用于接收保护单元根据监测信息下发的控制命令；保护单元，根据电网被保护对象的类型，将多核计算能力虚拟化为多个实时运行的保护程序，使每个保护程序根据电网被保护对象的类型从采集执行单元获得相应的采集数据，并根据采集数据进行电网保护，下发所述控制指令至采集执行单元。本发明的间隔层设备软硬件解耦，充分发挥了嵌入式多核处理器硬件实时计算支撑能力、强通信互联能力、软件虚拟化多程序并行计算能力，增强了新型保护装置的功能、性能、可靠性及适应性能力等，满足应用需求，极大提升电网安全稳定运行的能力和继电保护装置的生命力。