本发明属于风洞设备设计领域，公开了一种应用于大型柔壁喷管的动密封结构及其使用方法。动密封结构包括充气密封件和泛塞密封件；在喷管型面壁的接触端面上，从内至外依次设置环形的泛塞密封件和环形的充气密封件；充气密封件包括整体式的充气软管和圆环形的密封条；充气软管包括外环和内环；外环设置有气流管道，充气口外接高压气源，放气口设置放气阀门；内环设置环形的通槽，密封条嵌入通槽内，并凸出喷管型面壁的接触端面，压紧喷管侧壁，进行喷管型面壁与喷管侧壁之间的密封。该动密封结构使用方法简单可靠。本发明的应用于大型柔壁喷管的动密封结构及其使用方法解决了在吹风条件下，喷管型面壁与喷管侧壁之间的动密封问题。