本发明公开了一种多区域时序生产模拟联络线的功率越限处理方法及系统，包括：获取各分区的综合负荷曲线和各分区的机组在每个时刻的开机信息；根据综合负荷曲线和开机信息进行直流潮流计算，确定每条联络线在每个时刻的交流联络线功率；对于任一条联络线，将该任一条联络线在每个时刻的交流联络线功率和该任一条联络线对应的联络线功率阈值进行比较，确定该任一条联络线对应的交流联络线功率越限的时刻；对于存在交流联络线功率越限的任一目标联络线，根据任一目标联络线对应的交流联络线功率越限的时刻对应的开机信息，以发电机功率的调整量平方和最小为优化目标，进行分区机组出力的调整，以使得任一目标联络线不存在交流联络线功率越限的时刻。