本发明公开了一种含有细胞穿透肽的香稻增香剂及其制备方法和应用，涉及水稻栽培技术领域，包括纳米脂质体和水，所述纳米脂质体的原料包括合成卵磷脂、表面活性剂、细胞穿透肽、偶氮二异丙基咪唑啉盐酸盐、锌肥、脯氨酸、5‑氨基乙酰丙酸和γ‑氨基丁酸；合成卵磷脂是由二油酰基磷脂酰乙醇胺‑聚氧乙烯聚氧丙烯嵌段共聚物和/或1‑棕榈酰基‑2‑油酰基磷脂酰胆碱组成。本发明还公开了香稻增香剂的制备方法和应用方法，利用了全新的聚合制备方法，制备更简便，提高了香稻增香剂纳米脂质体的稳定性；制备过程无需添加有机溶剂，对环境友好，使用该香稻增香剂进行人工喷雾或飞防喷施时，对香稻的增香增产效果显著。