本发明一种铜基沸石分子筛杂化材料及其制备方法和应用，属于材料领域。该方法利用二价铜盐与沸石分子筛进行离子交换获得二价铜离子交换的沸石分子筛，二价铜离子在沸石分子筛的孔道限域效应以及与分子筛骨架负离子之间的电荷相互作用下，被还原剂原位还原形成非晶态的低价态铜离子团簇以化学键的形式稳定分散在沸石分子筛孔道的杂化材料。该方法制备的杂化材料具有较高的酸性位、丰富的缺陷位以及大量的非晶态低价铜离子团簇，该非晶态低价态铜离子团簇可与有机硫(如：二苯并噻吩)发生络合作用，表现出较大的穿刺硫容和良好的循环稳定性。