本发明公开了一种网络通信数据处理系统，涉及数据传输处理技术领域，解决了未对网络通信数据进行加密处理，而且外部的不法人员很容易便攻破传输通道，严重影响网络安全的技术问题，将主要数据进行分割，再对分割得到的数据流进行镜像加密，使若干组数据流划分为两组数据流组，采用对应的数字标记进行标记处理，对已经完成下标标识处理的后的对应标记采用隐藏因子进行替换，并生成逻辑因子，再对不同的数据流包采用传输终端进行传输，采用此种方式对网络通信数据进行处理，便可充分保障网络通信数据在传输过程中的安全性，在一定程度上保护了通信数据，避免外部人员对整个数据进行窃取，并在窃取后，也很难在一定时间内对此类数据进行整合。