本发明提供一种有机催化剂改良近临界水提取烟叶生物质制备有机肥的方法，包括：S1、取料；称取烟叶样品和蒸馏水，烟叶样品与蒸馏水的质量比为1:50‑10:50；称取有机催化剂，有机催化剂为HCOONa、CH3COONa、HCOOK、CH3COOK、(CH3COO)2Zn和(CH3COO)2Ni中的一种，有机催化剂的用量为烟叶样品的2％‑16％；S2、投料；将装有S1中称取物的内衬投入反应釜内，封闭反应釜；S3、反应；设置程序升温，使反应温度为140℃‑280℃，温度达标后，设置保温时间为0min‑90min；S4、离心；反应结束，却至室温，取出内衬，离心；S5、制备有机肥。本发明通过引入特定的有机催化剂，提高烟叶转化率和生物质产率，进一步完善近临界水技术在烟叶提取领域的不足；所得液体提取物可直接用于制备有机肥，固体残渣可用做制备炭基肥。