本发明公开了一种用于海洋直流接地极区域土壤结构的建模方法及系统，属于防雷接地技术领域。本发明方法，包括：获取海洋直流接地极在不同测量极距下的视在土壤电阻率；确定海洋直流接地极，在不同位置和测试极距下的海水影响修正系数；使用所述海水影响修正系数对所述视在土壤电阻率进行修正，获取海岸土壤真实视在电阻率；根据所述海岸土壤真实视在电阻率，获取海岸土壤的分层结构；根据获取的海岸土壤的分层结构，建立海洋直流接地极区域土壤结构的模型。本发明能够实现对海岸及海水电阻率结构的精确模拟，可提高海洋直流接地极设计计算的准确性。