本发明公开了一种层间多次波预测方法及装置，方法包括：对地震数据进行拆分处理，得到拆分后的上部数据及下部数据；对上部数据及下部数据分别进行第一变换处理，得到对应的频率域上部数据及频率域下部数据；将频率域下部数据与频率域上部数据的共轭复数进行多次乘积处理，得到乘积数据体；将乘积数据体进行第二变换处理，得到预测的层间多次波数据。通过将地震数据拆分为上部数据及下部数据，变换为对应的频率域上部数据及频率域下部数据，将频率域下部数据与频率域上部数据的共轭复数进行多次乘积处理后再变换，可以得到预测的层间多次波数据，可以降低层间多次波对地震数据的干扰，提升地震资料的成像品质。