本发明公开了用于小动物运动训练和超声刺激双重闭环康复系统与方法，属于生物医学领域，包括机器人辅助训练平台、超声刺激平台和分析与控制平台；机器人辅助训练平台用于对动物进行运动训练，并采集行为训练数据，还能够根据分析与控制平台的命令数据调整其对动物的训练运动姿态和动物跑道系统的运动速度，并将当前运动训练数据输出至分析与控制平台；超声刺激平台用于对动物施加超声刺激作用，同时采集动物的脑肌电数据；分析与控制平台与机器人辅助训练平台和超声刺激平台相连接，用于分析受试动物的行为训练数据和脑肌电数据，计算出动物运动姿态调节数据和超声刺激调节数据。本发明实现了小动物的运动训练和超声神经调控双重闭环康复。