本发明公开了一种核壳结构低温脱硝耐硫催化剂的制备方法。首先，将水、硅源、碱源、铝源和模板剂混合搅拌至均匀，在120~180℃中晶化1~7 d，晶化产物抽滤、烘干，焙烧，得到FeCu‑SSZ‑13分子筛；然后，将FeCu‑SSZ‑13分子筛均匀分散到溶剂中，加入硅源，搅拌，抽滤、干燥得到固体产物；最后将固体产物、铝源、水、碱源混合均匀，在30‑80℃下晶化6‑12 h，抽滤、干燥，得到核壳结构的FeCu‑SSZ‑13@NaA分子筛催化剂。本发明方法能够解决分子筛催化剂低温脱硝耐硫性能差，现有核壳结构催化剂中壳层吸附SO2饱和导致脱硝活性下降，以及SCR反应过程中NH3溢出造成环境污染等问题。