本发明涉及一种阻燃回收餐盒聚丙烯复合纤维的制备方法，首先将经过清洗的废旧回收餐盒聚丙烯与含硅基团的烯烃单体共混并作为芯层，将含有硅氧烷末端的阻燃聚酯作为皮层，通过复合纺丝制备初生复合纤维，然后将初生复合纤维进行热处理制得所述阻燃回收餐盒聚丙烯复合纤维；含有硅氧烷末端的阻燃聚酯为具有硅氧烷末端的聚酯与和环状磷酸酯的混合物；热处理包括两个阶段，第一阶段在水槽中进行，水槽温度为100～110℃，水槽中的pH值为7.5±0.1，第二阶段通过加热辊完成并发生交联反应，拉伸倍数为3.5～4.5倍，一辊温度为80～95℃，二辊温度为120～140℃。本发明的方法有效解决了因两相界面结合力差、不持久而导致的纤维机械强度不足的性能缺陷。