本公开提出一种用于复杂山区的风力发电机组智能偏航控制系统及方法，该系统中采集模块用于采集复杂山区的偏航环境数据，偏航环境数据包括风速、风向和湍流强度；主控模块用于基于偏航环境数据判断偏航动作条件是否满足，若满足，则生成最优对风角偏和偏航控制指令，并基于齿隙补偿算法生成调节指令；偏航执行模块用于在接收偏航控制指令后松开偏航电机的电磁抱闸以及打开液压刹车，基于调节指令通过伺服驱动器动态调节偏航电机的驱动力矩和电磁阻尼，偏航电机按照调节后的驱动力矩和电磁阻尼提供目标转速，偏航减速器将目标转速降速后控制偏航齿轮进行偏航。根据本公开的系统，能够提高偏航时的平稳性且减少机械磨损。