本发明公开了一种确定变压器铁芯损耗和谐波阻抗的方法及系统，所述方法包括：通过空载试验获取在不同输入电压值下变压器的铁芯损耗和输出电压；通过所述铁芯损耗和输出电压确定第一系数和第二系数，并基于所述第一系数和第二系数确定变压器的铁芯损耗计算模型，以基于所述铁芯损耗计算模型确定变压器的铁芯损耗；通过不同纯谐波电压下变压器的短路试验确定第三系数和第四系数，并基于所述第三系数和第四系数确定变压器的谐波阻抗计算模型，以基于所述谐波阻抗计算模型确定所述变压器的谐波阻抗。通过本发明的方法能够实现快速准确地确定变压器的谐波阻抗，还可以根据谐波阻抗得到变压器的谐波损耗值。