本发明属于农业监测技术领域，具体是一种基于移动终端农业监测预警方法及系统，预警系统包括农业监测预警平台，农业监测预警平台通信连接农业监测分区模块、农作物生长态势判断模块、区域协调性分析模块以及影响因素排查判断模块，且农业监测预警平台与移动终端通信连接；本发明通过农作物生长态势判断模块对监测子区域进行农作物生长态势分析，实现对农业监测区域内各个子区域的有效监测，通过区域协调性分析模块对农业监测区域进行协调性分析以使农业管理人员及时了解各个监测子区域之间农作物生长态势差异状况，通过影响因素排查判断模块对不合格监测子区域进行因素关联性分析，以便后续对相关区域加强区域。