本发明公开了一种考虑分时电价的新能源制氢系统的运行控制策略，属于电制氢系统控制技术领域。首先执行制氢负荷跟踪策略，计算当前新能源发电功率盈余或电解水制氢功率缺额；其次，制氢功率存在缺额时，进入分时电价运行模式，新能源发电功率出现盈余时，进入余电上网运行模式；然后，对两种运行模式进行储能状态判断、变流器状态判断或分时电价判断，执行相应运行控制策略；最后，迭代计算直至达到设定时长时，根据迭代计算结果求解当前容量配置方案下系统的优化目标函数或适应度函数，进而确定系统的最优容量配置方案。本发明可以充分保障制氢负荷的稳定得电，充分利用风能和太阳能，减少弃风弃光，有利于整个系统经济高效地运行。