本发明适用于作物收获机械技术领域，提供了一种长根茎类中草药挖掘收获机，包括机架和分离装置，多个分离装置呈圆周阵列分布式安装在支撑框架上；所述分离装置包括：分离罐，所述分离罐支撑固定安装在所述支撑框架上，所述分离罐的底端具有落土通道，所述落土通道的底端延伸至碎土腔内；去土机构，所述去土机构升降式设置在所述分离罐内，所述去土机构在所述分离罐内所处的高度通过第一电动伸缩杆进行调整。本发明提供的长根茎类中草药挖掘收获机能够实现对草药根茎上的土块的有效去除，便于草药根茎的收获，减少传统草药根茎收获过程还需额外工序实现去土的过程，提高了草药根茎收获的效率。