本发明公开了一种安瓿瓶装药物智能调配系统，涉及智能调配系统技术领域，其包括工作台；工作台的顶部与进料传送机构相邻的一侧安装有能够将安瓿瓶横向输送的物料输送机构；物料输送机构上安装有对横向输送的安瓿瓶进行灭菌的灭菌机构；工作台的顶部在物料输送机构远离进料传送机构的一侧安装有能够使安瓿瓶进行站立的瓶体站立机构；所述工作台的顶部一侧固定安装有控制模块，所述控制模块包括PLC控制器和与其电连接的至少一个电缸；本发明中，在进料传送机构、物料输送机构、灭菌机构、瓶体站立机构、瓶体夹持机构、瓶口切割开瓶机构以及控制模块相互配合的情形下，能够更好的实现药物的智能调配。