本发明属于建筑结构技术领域，具体公开了一种医疗建筑顶层结构，包括围栏、楼体顶板和排水单元，围栏固接于楼体顶板上，楼体顶板设置于楼体的顶部，排水单元包括引流管和排水管，排水管连接在楼体的侧壁处，围栏内开设有导水槽，引流管的两端分别与导水槽和排水管连通，引流管上连接有密封盖，密封盖与排水管固接，围栏上开设有若干个进水孔，围栏上设有风扇，风扇的高度高于引流管的高度设置。通过在围栏中开设导水槽，可以对雨水进行引流，从而使雨水快速的从楼体的顶部流出，避免雨水的囤积在楼体顶板上，通过在围栏周侧安装风扇，风扇对导水槽内部进行抽风，加快导水槽内雨水的蒸发，进而避免发生渗漏的情况。