本发明公开了一种高产L‑苏氨酸的基因工程菌及其应用，该基因工程菌的宿主细胞为需钠弧菌ATCC14048，宿主细胞基因组中的TDH基因、THRL基因被敲除，THRA基因的第433位甘氨酸突变为精氨酸；TDH基因、THRL基因和THRA基因的的碱基序列依次如SEQ ID NO.1、2和3所示；重组质粒包含有RHTC基因；RHTC基因的碱基序列如SEQ ID NO.4所示。本发明通过天然转化的基因编辑方法实现了2个基因的敲除和1个基因的点突变，并通过质粒过表达1个外源基因，首次构建获得能通过发酵法生产L‑苏氨酸的需钠弧菌，该工程菌生长周期短，能高产L‑苏氨酸，具有潜在商业应用前景。