本发明涉及混凝土外加剂技术领域，特别涉及一种防水抗渗型修补砂浆及其制备方法，其防水抗渗型修补砂浆的原料包括普通硅酸盐水泥、快硬硫铝酸盐水泥、石膏、石英砂、二氧化硅包覆的壳核结构憎水材料、可再分散乳胶粉、保水增稠材料、碳酸锂和减水剂；二氧化硅包覆的壳核结构憎水材料为将二氧化硅基的聚合物基网络聚合物加入至有机硅憎水剂与分散剂混合的水溶液中经过滤干燥制得；二氧化硅基的聚合物基网络聚合物由水包油乳液和预水解物混合后经洗涤干燥后得到，水包油乳液为将表面活性剂和脲醛树脂混匀后滴加水制得；预水解物为将三乙酰氧基乙基硅烷置于酸性水溶液中加热得到。该修补砂浆具较好的防水性、抗渗透能力、拉伸粘结强度和保水性。