本发明涉及一种提高雪莲绿原酸含量SiHQT基因及其编码产物和应用，属于基因工程技术领域，所述的SiHQT基因具有SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列，其编码的蛋白质具有SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列。本发明还提供包含所述SiHQT基因的重组载体。SiHQT能够对咖啡酰CoA和香豆酰CoA两种底物产生作用，生成绿原酸和香豆酰奎尼酸，可以通过调控SiHQT基因的表达来提高雪莲中绿原酸合成，并通过细胞培养工程进行遗传改良雪莲品系。